鞋面改為編織面料
耐克Vaporfly next% 1代采用Vaporweave材質，這種材質的優點是輕量透氣，拒水性佳，但是舒適度上要差一些。2代的Vaporfly NEXT%改為了編織面料。

鞋頭部位整體更寬松
耐克Vaporfly next% 1代的鞋頭部位稍緊，部位跑者穿著會感覺有點擠腳，2代在鞋頭部位相較加寬，使得鞋子在穿著舒適度上會提升一些。

鞋頭新增防撞設計
鞋頭防撞設計的作用一個是減少腳趾擦傷或碰撞，一個是保護大拇指部位網面的耐久性。很多人穿著1代Vaporfly NEXT%跑步過程中會出現頂腳趾的情況，2代進行了針對性的改良。

鞋身側面支撐性補強
耐克Vaporfly next% 1代Vaporfly NEXT%穿到后期部分跑者會出現鞋身側面開裂的情況，2代在鞋身側面進行了支撐補強，以提升鞋子的整體強度，延緩壽命。

鞋帶采用Alphafly NEXT%類似的設計
扁平式的鞋帶設計可以避免鞋帶散開，提升跑步體驗。

后跟部位新增防磨條
部分跑者會出現磨后跟或是腳踝的情況，2代新增了防磨條的設計，以減少減輕這一狀況。